Environ 300 doctorants soutiennent leur thèse en Bourgogne-Franche-Comté chaque année.

En juin 2026, le Collège doctoral et les établissements ont organisé deux Cérémonies en l’honneur des docteurs 2025.

Une cérémonie a eu lieu à Dijon le 5 juin et une autre à Besançon le 9 juin pour célébrer les docteurs des 5 établissements de Bourgogne-Franche-Comté accrédités pour délivrer le plus haut diplôme.